Siedziba organizacji funkcjonuje w Domu Kultury Polskiej w Wilnie. Siedziba służy do reprezentacji nagród organizacji, przyjmowania szanownych gości i przyjaciół harcerstwa, a najważniejsze – jest dostępna dla harcerzy i harcerek. Co tydzień w siedzibie odbywają się różnego rodzaju szkolenia, spotkania zarządu i naczelnictwa, odbywają się zbiórki zuchowe i drużyn, a także zebrania z rodzicami. Utrzymanie siedziby ZHPnL jest finansowane ze środków KPRM.
Związek Harcerstwa Polskiego na Litwie jest jedną z największych i najbardziej dynamicznych organizacji polskich na Litwie, która liczy prawie 35 lat. Jest organizacją wychowawczą, skupiającą w swych szeregach dzieci i młodzież. Obecnie skupia ponad 750 osób, aktywnie działających na rzecz środowiska polskiego i litewskiego.